Dupa ce l-a salvat pe Scooby-Doo si banda lui  de niste ticalosi cu adevarat periculosi, Batman apeleaza la ajutorul lui Mystery Inc. pentru a-l ajuta sa-si rezolve unul dintre putinele cazuri nerezolvate, cand apar noi informatii. Intre timp, ei trebuie sa se ocupe si de un nou personaj misterios, care se numeste \"Manta Crimson\", si care intentioneaza sa preia Gotham City.